1) Для маркеров ненумерованных списков использовать стандартные тире вместо дефиса.
2) Перед названием главы 1.3 большой отступ. Скорее всего, там, помимо пустой строки, не отключен интервал после абзаца.
3) Посмотрите в интернете, как настроить отображение кириллических шрифтов в вашем редакторе IDEF0, чтобы названия диаграмм отображались корректно.
4) В некоторых местах по тексту, где должны быть тире, у вас стоят дефисы.
5) Для каждой таблицы er-диаграммы в 3 главе нужно расписать в тексте таблицу формата Название параметра|Тип данных|Назначение.